Le commerce est radicalement différent de ce qu'il était dans Civ2. Il n'y a plus de caravanes, et il est beaucoup moins abstrait. Cette fois-ci vous devez échanger directement des produits et aussi ramener ceux que vous échangez de l'étranger. Vous pouvez tout aussi bien échanger des ressources (utiles à la constitution d'une armée) que des produits de luxe (maintenir le bien-être de sa population).

Les ressources et produits de luxe sont donc d'une importance stratégique dans le jeu, d'autant plus qu'ils interviennent directement dans la diplomatie. Il est préférable pour une nation qui veut se développer convenablement de rester en paix avec ses voisins et de maintenir de bons échanges avec ces derniers. De la même façon, une nation pourra imposer des embargos commerciaux, conclure des traiter commerciaux, etc... Il faut savoir qu'avant de pouvoir utiliser une ressource pour le commerce, il faut d'abord avoir découvert la technologie qui s'y rapporte. On ne peut pas connaitre l'existence du fer si l'on n'a pas encore découvert la technologie Travail du Fer. De ce fait, toutes les ressources qui sont inutilisables, parce que les technologies correspondantes n'ont pas été découvertes, sont simplement cachées aux yeux de votre civilisation. Vous pouvez très bien être implantés sur une gigantesque mine d'uranium sans le savoir.
Si une civilization veut se lancer dans l'exploitation de ressources éloignées de ses villes, elle doit avant tout développer sa sphère d'influence culturelle qui étendra ainsi ses frontières. Voici quels sont les produits de luxe dans le jeu :
<ul><li>soie</li> <li>raisin / vin</li> <li>éléphant / ivoire</li> <li>épices</li> <li>or</li> <li>gemmes / diamant</li> <li>teinture</li> <li>encens</li></ul>